Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ckap5A2AGT5 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ckap5A2AGT5 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ckap5A2AGT5 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Ckap5A2AGT5 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Ckap5A2AGT5 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ckap5A2AGT5 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ckap5A2AGT5 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Ckap5A2AGT5 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Ckap5A2AGT5 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Ckap5A2AGT5 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ckap5A2AGT5 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ckap5A2AGT5 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Ckap5A2AGT5 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Ckap5A2AGT5 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ckap5A2AGT5 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ckap5A2AGT5 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ckap5A2AGT5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ckap5A2AGT5 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Ckap5A2AGT5 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Ckap5A2AGT5 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ckap5A2AGT5 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ckap5A2AGT5 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ckap5A2AGT5 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ckap5A2AGT5 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ckap5A2AGT5 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ckap5A2AGT5 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms