Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8nlA2ABX0 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms