Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms