Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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Speer3W4VSP1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Speer3W4VSP1 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Speer3W4VSP1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Speer3W4VSP1 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Speer3W4VSP1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer3W4VSP1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms