Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms