Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2T6

Krt85, Keratin, type II cuticular Hb5, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt85Q9Z2T6 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt85Q9Z2T6 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt85Q9Z2T6 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms