Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ubl3Q9Z2M6 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ubl3Q9Z2M6 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ubl3Q9Z2M6 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ubl3Q9Z2M6 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ubl3Q9Z2M6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ubl3Q9Z2M6 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ubl3Q9Z2M6 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ubl3Q9Z2M6 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ubl3Q9Z2M6 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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