Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx1Q9WV80 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx1Q9WV80 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx1Q9WV80 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx1Q9WV80 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx1Q9WV80 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx1Q9WV80 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx1Q9WV80 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Snx1Q9WV80 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Snx1Q9WV80 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Snx1Q9WV80 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Snx1Q9WV80 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Snx1Q9WV80 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Snx1Q9WV80 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Snx1Q9WV80 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Snx1Q9WV80 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Snx1Q9WV80 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Snx1Q9WV80 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Snx1Q9WV80 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Snx1Q9WV80 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx1Q9WV80 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms