Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Sh3bgrQ9WUZ7 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Sh3bgrQ9WUZ7 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Sh3bgrQ9WUZ7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Sh3bgrQ9WUZ7 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Sh3bgrQ9WUZ7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Sh3bgrQ9WUZ7 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Sh3bgrQ9WUZ7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Sh3bgrQ9WUZ7 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Sh3bgrQ9WUZ7 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Sh3bgrQ9WUZ7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms