Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sema6cQ9WTM3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sema6cQ9WTM3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Sema6cQ9WTM3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sema6cQ9WTM3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sema6cQ9WTM3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sema6cQ9WTM3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sema6cQ9WTM3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sema6cQ9WTM3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sema6cQ9WTM3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sema6cQ9WTM3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sema6cQ9WTM3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sema6cQ9WTM3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sema6cQ9WTM3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sema6cQ9WTM3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sema6cQ9WTM3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sema6cQ9WTM3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sema6cQ9WTM3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sema6cQ9WTM3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sema6cQ9WTM3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sema6cQ9WTM3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sema6cQ9WTM3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sema6cQ9WTM3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sema6cQ9WTM3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sema6cQ9WTM3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sema6cQ9WTM3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sema6cQ9WTM3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Sema6cQ9WTM3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Sema6cQ9WTM3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sema6cQ9WTM3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sema6cQ9WTM3 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Sema6cQ9WTM3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Sema6cQ9WTM3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sema6cQ9WTM3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sema6cQ9WTM3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sema6cQ9WTM3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sema6cQ9WTM3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sema6cQ9WTM3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sema6cQ9WTM3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sema6cQ9WTM3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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