Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tomm40Q9QYA2 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tomm40Q9QYA2 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tomm40Q9QYA2 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tomm40Q9QYA2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tomm40Q9QYA2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tomm40Q9QYA2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tomm40Q9QYA2 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tomm40Q9QYA2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tomm40Q9QYA2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tomm40Q9QYA2 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tomm40Q9QYA2 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tomm40Q9QYA2 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tomm40Q9QYA2 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tomm40Q9QYA2 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tomm40Q9QYA2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tomm40Q9QYA2 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tomm40Q9QYA2 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tomm40Q9QYA2 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms