Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcnip3Q9QXT8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Kcnip3Q9QXT8 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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