Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1eQ9JMK2 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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