Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Rabgef1Q9JM13 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Rabgef1Q9JM13 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Rabgef1Q9JM13 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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