Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Hmgn5Q9JL35 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Hmgn5Q9JL35 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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