Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL19

Ncoa6, Nuclear receptor coactivator 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,067 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa6Q9JL19 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Ncoa6Q9JL19 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Ncoa6Q9JL19 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Ncoa6Q9JL19 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Ncoa6Q9JL19 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Ncoa6Q9JL19 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ncoa6Q9JL19 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ncoa6Q9JL19 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ncoa6Q9JL19 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ncoa6Q9JL19 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Ncoa6Q9JL19 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ncoa6Q9JL19 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms