Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb3Q9JKS4 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms