Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trem1Q9JKE2 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trem1Q9JKE2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trem1Q9JKE2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trem1Q9JKE2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trem1Q9JKE2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trem1Q9JKE2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trem1Q9JKE2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trem1Q9JKE2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trem1Q9JKE2 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Trem1Q9JKE2 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trem1Q9JKE2 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms