Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms