Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rb1cc1Q9ESK9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms