Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
DysfQ9ESD7 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
DysfQ9ESD7 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
DysfQ9ESD7 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
DysfQ9ESD7 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
DysfQ9ESD7 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
DysfQ9ESD7 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
DysfQ9ESD7 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
DysfQ9ESD7 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
DysfQ9ESD7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
DysfQ9ESD7 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
DysfQ9ESD7 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
DysfQ9ESD7 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
DysfQ9ESD7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
DysfQ9ESD7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
DysfQ9ESD7 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
DysfQ9ESD7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
DysfQ9ESD7 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
DysfQ9ESD7 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
DysfQ9ESD7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
DysfQ9ESD7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
DysfQ9ESD7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
DysfQ9ESD7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
DysfQ9ESD7 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
DysfQ9ESD7 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
DysfQ9ESD7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
DysfQ9ESD7 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
DysfQ9ESD7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms