Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cmtm7Q9ESD6 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cmtm7Q9ESD6 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cmtm7Q9ESD6 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cmtm7Q9ESD6 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cmtm7Q9ESD6 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cmtm7Q9ESD6 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cmtm7Q9ESD6 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms