Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ush1cQ9ES64 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms