Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clstn1Q9EPL2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms