Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc97Q9DBT3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc97Q9DBT3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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