Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms