Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms