Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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