Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms