Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms