Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms