Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q9D7E4 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q9D7E4 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q9D7E4 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q9D7E4 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q9D7E4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q9D7E4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Q9D7E4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms