Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9bQ9D6E4 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms