Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms