Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mrpl53Q9D1H8 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms