Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rfc5Q9D0F6 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rfc5Q9D0F6 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rfc5Q9D0F6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rfc5Q9D0F6 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rfc5Q9D0F6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rfc5Q9D0F6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rfc5Q9D0F6 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rfc5Q9D0F6 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rfc5Q9D0F6 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rfc5Q9D0F6 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rfc5Q9D0F6 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Rfc5Q9D0F6 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Rfc5Q9D0F6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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