Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ccdc47Q9D024 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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