Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Snf8Q9CZ28 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Snf8Q9CZ28 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Snf8Q9CZ28 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Snf8Q9CZ28 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Snf8Q9CZ28 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Snf8Q9CZ28 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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