Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CYI0 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CYI0 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CYI0 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CYI0 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CYI0 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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