Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Utp23Q9CX11 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Utp23Q9CX11 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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