Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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