Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms