Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms