Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms