Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pkp2Q9CQ73 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pkp2Q9CQ73 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pkp2Q9CQ73 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pkp2Q9CQ73 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pkp2Q9CQ73 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pkp2Q9CQ73 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pkp2Q9CQ73 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pkp2Q9CQ73 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pkp2Q9CQ73 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pkp2Q9CQ73 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pkp2Q9CQ73 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pkp2Q9CQ73 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pkp2Q9CQ73 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pkp2Q9CQ73 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pkp2Q9CQ73 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pkp2Q9CQ73 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pkp2Q9CQ73 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pkp2Q9CQ73 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pkp2Q9CQ73 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pkp2Q9CQ73 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pkp2Q9CQ73 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pkp2Q9CQ73 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pkp2Q9CQ73 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pkp2Q9CQ73 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pkp2Q9CQ73 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pkp2Q9CQ73 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pkp2Q9CQ73 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pkp2Q9CQ73 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pkp2Q9CQ73 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pkp2Q9CQ73 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pkp2Q9CQ73 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pkp2Q9CQ73 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pkp2Q9CQ73 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pkp2Q9CQ73 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pkp2Q9CQ73 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pkp2Q9CQ73 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pkp2Q9CQ73 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pkp2Q9CQ73 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pkp2Q9CQ73 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pkp2Q9CQ73 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms