Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4921530L21RikQ9CQ47 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms