Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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