Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl27Q99N92 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl27Q99N92 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms