Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms