Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm1866-201ENSMUST00000120701 477 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 AC118006.2-201ENSMUST00000224167 962 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4dQ99N05 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms